Je to jeden z nejvzácnějších ptáků, kteří v Česku hnízdí. Čáp černý je velmi plachý, proto si staví hnízda hluboko v lesích a vysoko v korunách stromů, třeba v Brdech. Najít je není tak snadné jako jejich příbuzného čápa bílého. Přírodovědci ale ze zkušenosti vědí, kam zaměřit svou pozornost. V těchto dnech kroužkují mláďata, která zatím tráví čas na hnízdě. Rostou ale velmi rychle. Mláďata čápa černého kroužkovali experti také na Plzeňsku.

Mlok skvrnitý je u nás silně ohroženým druhem. Vinu na tom nese především lidská činnost spojená s kácením lesů a znečišťováním přírodních toků, jezírek či studánek. Někde jim však lidé jdou naproti. Například v městském rybníčku Olšovka v lese u Zábělé v Plzni se těmto obojživelníkům nyní dobře daří a podobně jsou na tom i v Brdech, kde se ochránci přírody s rýči pustili do obnovy tůněk, v nichž se mloci rozmnožují.